O câncer de esôfago teve o maior número de sinais após os critérios geográficos exploratórios: 16 municípios.
Cinco estão no Sul, onde estudos já associam esse câncer ao consumo de bebidas muito quentes, como o chimarrão em temperatura muito alta, e também ao álcool e ao tabaco. Nove estão em diferentes regiões de Minas Gerais e dois na Bahia, com mortalidade observada entre 2,4 e 3,6 vezes o esperado pela média nacional, após a suavização estatística. Para esses, os dados analisados não apontam uma explicação, o que não significa que ela não exista. Em testes de sensibilidade, 14 dos 16 mantêm o sinal em todos os cenários. E, em 2015–2019, período que não foi usado para escolhê-los, 12 dos 16 apresentaram novamente excesso de mortalidade pelo critério definido. Isso sustenta a persistência do padrão no tempo, mas não distingue excessos reais de vieses persistentes nem estabelece causalidade. Uma verificação seguinte (Fase 1b) encontrou participação maior do câncer de esôfago entre os casos de câncer atendidos em hospitais (registro hospitalar do INCA) nos 16, atendendo ao critério estatístico em 14; é uma proporção entre casos hospitalares, não um risco na população. Eles ficam dentro de áreas regionais maiores cujo excesso persiste ao longo de 2015–2024. Voltando no tempo (Fase 1c), o excesso já existia em 2000–2014, com dados que não participaram da seleção: os 16 juntos tiveram 1,9 vez os óbitos esperados para seus estados, e não houve excesso de câncer de pulmão nem dos outros cânceres; parte da alta ao longo do tempo pode refletir a melhora do registro. São perguntas para especialistas, não respostas.